O Orquidário tem por função a manutenção de um banco de germoplasma de orquídeas, visando a sua conservação, incluindo a de espécies raras, e a fornecer material para estudos acadêmicos sobre orquídeas. Incluso no Orquidário, o Laboratório de Cultura de Tecidos de Orquídeas tem por função a propagação in vitro de orquídeas, seja por cultura de sementes, seja por cultura de meristemas, para a manutenção da própria coleção do Orquidário.